Je ne connais rien aux tests ADN et je voudrais savoir...

Voici un guide rapide pour le débutant qui ne veut pas en savoir plus que requis.

• Qu'est-ce qu'un test ADN ?
• Un peu de vocabulaire
• Quel labo choisir ?
• Et les autres labos ?
• Parenté proche
• Recherche de parents biologiques
• Recherche d'enfants biologiques
• Recherche de cousins
• Je ne vois pas mon cousin parmi mes matches/correspondances
• Faire un test anonyme
  

Qu'est-ce qu'un test ADN ?

Un test ADN se fait en plusieurs étapes.

• Vous achetez une trousse de prélèvement (et souvent, le test ADN en même temps);
  
• puis vous recevez cette trousse;
  
• vous faites le prélèvement et retournez la trousse au labo;
• vous recevez un accusé-réception du labo par courriel;
• après un certain temps, l'analyse en soi est faite et vous recevez un nouveau courriel;
• puis, la comparaison est faite avec d'autres résultats et de temps en temps, vous aurez un message disant qu'on a trouvé une correspondance, ou il faudra visiter le site web du labo pour vérifier.

Le prélèvement se fait en général en crachant de la salive dans une éprouvette. Par précaution, on envoie normalement 2 éprouvettes. C'est pour la même personne. Si vous testez 2 personnes, commandez 2 trousses et prenez soin de ne pas mélanger les trousses ou les numéros de trousse (kit number). Le labo FTDNA utilise plutôt un frottis fait à l'intérieur de la joue parce qu'il permet de faire plusieurs tests ADN alors que presque tous les autres ne font qu'une fois leur test ADN.

S'il y a des problèmes, il est important de répondre au courriel du labo et de corriger ce problème. Par exemple, on peut demander une signature ou l'âge a été mal inscrit.

Un peu de vocabulaire

• Labo : laboratoire où se fait l'analyse ADN. Pour les gros labos, c'est celui où vous commandez ou expédiez votre trousse. Pour certains, c'est un site extérieur. Si c'est un revendeur, c'est l'endroit où les tests sont réellement faits (et vous payez pour les intermédiaires, pas pour une meilleure qualité du produit).
• Analyse ADN : une machine examine votre salive et extrait une certaine quantité d'informations avant de les assembler.
• Chromosomes : ce sont les brins d'ADN. Il y en a 23 paires chez les humains. Ils sont numérotés de 1 à 22. La 23e paire est appelée XY chez l'homme et XX chez la femme. Il y a aussi le chromosome MT contenu dans les mitochondries données par la mère à ses enfants. Dans les résultats, on parlera donc des chromosomes 1 à 22, du X, du Y et du MT.
• Distance génétique : c'est le nombre de différences entre deux résultats Y ou MT. Ce n'est pas le degré de parenté.
• ADN partagé : c'est la partie commune de l'ADN entre 2 personnes. Comme on n'hérite pas des mêmes morceaux d'ADN (excepté des jumeaux identiques), l'ADN partagé n'est jamais un chiffre précis. La plupart des sites de référence utilisent les cM pour mesurer cette partie commune (parce que c'est plus facile à comparer : 60 cM ou 0,8 % par exemple).
• Résultats d'une analyse ADN : dans les principaux labos, le résultat a 2 éléments principaux.
• Les résultats bruts. Ce sont les données en soi, qu'on examine rarement et qui sont comparées par les algorithmes des laboratoires.
• Les correspondances ou matches. Ce sont les autres résultats qui pourraient être apparentés avec la personne testée.
• Précision ou exactitude :
  
• Un test est précis et exact. On lit l'ADN de façon précise et exacte, mais de façon imparfaite (il y a ce qu'on appelle des "no-calls" ou des éléments qu'on n'a pas pu lire (autour de 2%).
• Le degré de parenté ne peut pas être exact. Ainsi, si vous avez 2000 cM en commun, la probabilité est de 99% qu'il s'agisse d'un lien grand-parent/petit-enfant, oncle/tante/neveu/nièce ou demi-frère/soeur, et 1% pour frère/soeur. Avec 2450 cM, ce sera 99% pour frère/soeur et 1% pour l'autre possibilité. Et avec 2250 cM, c'est 50%. Voyez le site DNA Painter pour vous faire une idée de ces variations.
• Test Y ou ADN-Y : test ADN réservé aux hommes (les seuls ayant le chromosome Y).
• Test MT ou ADNmt : test ADN pour tous mais qui suit la lignée maternelle
• Test autosomal ou ADNat : test ADN pour tous, non directionnel, montrant la parenté proche
• Haplogroupe : résumé du résultat ADN-Y ou ADNmt. La lettre initiale est en gros la région évaluée au début de ces tests, et ce qui suit est une sous-catégorie. La nomenclature a varié. Voir les pages spécialisées pour d'autres détails. On peut comparer un haplogroupe à un nom de famille. Si un labo explore 4000 haplogroupes Y, c'est comme s'il associait 4000 noms de famille à sa clientèle mais des familles d'il y a 4000 ou 5000 ans, un peu comme on avait les descendants d'une tribu à cette époque.
  
• SNP : de façon précise, c'est la valeur lue à une position dans le chromosome Y. Par extension dans la plupart des sites de référence, y compris ISOGG qui englobe tout le monde, c'est une position ou loci dans un des chromosomes.
• Projet : chez FTDNA et yFull, on peut regrouper les résultats dans un projet et des bénévoles peuvent alors comparer vos résultats Y et MT avec ceux d'autres personnes.
  

Quel labo choisir ?

Les test ADN ne sont pas tous les mêmes. Il faut d'abord déterminer votre but. Voici les principaux labos. Cette liste ne comprend pas les nouveaux qui n'ont pas encore fait leurs preuves.

• FTDNA est le plus ancien labo ADN grand public. Il a débuté en 2000. Il offre un grand choix de tests (Y, MT et autosomal appelé Family Finder), permet d'y importer les résultats autosomaux d'autres labos, et a des bases pour comparer les résultats Y et MT de ce labo et autosomaux d'autres labos.
• AncestryDNA est en 2020 le plus gros labo ADN. Il a d'abord proposé plusieurs tests avant de n'offrir qu'un test autosomal et quelques fragments de Y et MT (inutilisables tels quels pour la généalogie). Le test n'est pas disponible en France (il faut utiliser ce qu'on appelle un "proxy" à la fois pour commander et pour examiner les résultats si on est en France. Cette restriction ne semble pas exister ailleurs.
  
• myHeritage fait son test chez FTDNA (avec un prix comparable), mais le résultat est un peu différent en ajoutant des éléments Y et MT.  Il permet aussi de recevoir les résultats d'autres labos.
• 23andMe se spécialise dans l'ADN médical qui n'est pas abordé ici. Il offre 2 tests, un pour généalogie (avec ADNau et des éléments Y et MT), et un autre à des fins médicales.
• YSEQ fait des tests Y et MT à la pièce, ainsi qu'un génome complet.
  
• Dante Labs et Full Genomes Corporation ainsi que Nebula offrent des tests ADN complets. Alors que les autres font un échantillonnage d'environ 700 000 positions, ces labos ont dans les 6 milliards de positions lues ! Toutefois, il n'y a pas de base de données de comparaison et leur test n'est pas nécessairement compatible avec les données de FTDNA.
  

Comparaisons entre labos. Voir https://isogg.org/wiki/Choosing_a_DNA_testing_company et http://www.beholdgenealogy.com/blog/?p=2700

Le nombre de positions testées ne semble pas être constant. J'ai testé plusieurs membres de ma parenté et le fichier de résultats a une longueur variable

Et les autres labos ?

La page ISOGG https://isogg.org/wiki/Choosing_a_DNA_testing_company montre un grand nombre de laboratoires par l'intermédiaire de ses liens (Y, MT, autosomaux). Si le but est généalogique, il est préférable d'utiliser un labo qui a une base de données de comparaison, comme les labos mentionnés plus haut.

Certains sites web ne sont pas des labos (ils ne font pas d'analyse ADN) mais comparent seulement les résultats ou font l'analyse de résultats. Voir les autres pages de ce guide.

Parenté proche

Si le but est de vérifier si deux personnes ont une parenté proche, il suffit de faire 2 tests autosomaux au même laboratoire et de regarder combien elles ont d'ADN partagé (shared DNA). Voyez par exemple le graphique de DNA Painter. Personnellement, je suggère de faire le test de FTDNA ou de myHeritage qui ont aussi des outils de comparaison. Notez que le résultat ne peut pas être précis. Sauf pour le cas parent-enfant, l'ADN partagé varie beaucoup.

Recherche de parents biologiques

Si le but est de trouver des parents biologiques, la méthode est en général la suivante : faire un test autosomal sur un gros site, puis explorer les arbres généalogiques des matches en partant des plus proches. Par recoupement, on finit par trouver des arrière-arrière-grand-parents probables, puis on se rapproche. Si vous êtes en France, notez que Ancestry ne livre pas directement dans ce pays. myHeritage est sans doute un meilleur choix car cette entreprise y fait de la publicité et a une grosse base de résultats.

Si vous faites un test avec FTDNA, vous pourrez éventuellement compléter avec un test Y (si un homme est testé) ou MT (pour la lignée maternelle). Voyons quelques cas.

• Homme cherchant son père biologique ou son grand-père paternel biologique : au Québec, on doit avoir autour de 50% de chances d'avoir un nom de famille avec un test Y-37 chez FTDNA. En France, la probabilité est très faible en comparaison.
  
• Femme cherchant son père biologique : ici, le chromosome Y ne sert à rien, vu que les femmes n'ont pas ce chromosome.
• Homme ou femme cherchant sa mère biologique : un test MT par le sujet et un examen de la généalogie des matches les plus proches permettrait d'identifier la lignée maternelle. Ici aussi, beaucoup de données au Québec et très peu en France.
• Méthode : on fait la généalogie des matches trouvés par le test autosomal (Family Finder chez FTDNA), ainsi qu'un test ADNmt chez FTDNA, puis on remonte les lignées féminines pour trouver la pionnière et son haplogroupe (voir le catalogue de signatures ADNmt https://www.francogene.com/triangulation/mt.php).
• Si on recherche un grand-parent, c'est un peu plus compliqué mais les mêmes concepts sont utilisables, en se rappelant que le Y est passé au fils et le MT aux enfants mais seules les filles le passent à la génération suivante.

Le phasage (phasing) consiste à éliminer des matches ceux d'un parent. Par exemple, vous cherchez la parenté d'un père adopté alors que la mère ne l'est pas. Avec FTDNA, vous trouvez un cousin maternel pour faire un 2e test Family Finder (ou vous demandez à votre mère), puis vous reliez les résultats de cette personne à votre arbre, et vous verrez alors la parenté maternelle dans les matches.

Il est peu probable que les parents biologiques ont fait un test ADN. Il faut plutôt se concentrer sur les cousins plus éloignés.

Évitez de contacter trop vite des parents trop proches car cela pourrait créer un malaise. Évitez de parler d'adoption ou de naissance sous X (en France).

Recherche d'enfants biologiques

Si le but est de retrouver un enfant laissé en adoption ou le fruit d'une aventure d'un soir, le facteur chance devient pratiquement le seul critère. Si l'enfant (ou ses enfants) n'a pas été testé, vous ne pourrez pas le trouver. Dans un tel cas, je suggère de tester avec tous les labos et d'essayer tous les sites d'analyse.

Recherche de cousins

Voir plus haut : Recherche de parents biologiques.

Je ne vois pas mon cousin parmi mes matches/correspondances

Si un cousin a fait un test ADN, il devrait apparaître parmi vos matches si certaines conditions sont remplies.

• Il faut que les deux tests soient dans la même base de données. Par exemple, vous êtes testé sur FTDNA et votre cousin sur 23andMe, alors vous ne le verrez pas dans vos matches. Mais s'il transfère ses résultats sur FTDNA, ou si vous les transférez tous les deux chez Gedmatch ou DNA.land (ou d'autres sites similaires), alors il devrait être parmi vos matches.
• Il faut que ce soit des tests semblables. Si vous faites un test Y et votre cousin un Family Finder, vous ne le verriez pas. Si c'est votre cousin paternel, il devrait paraître avec des tests Y. De même avec un cousin maternel pour le MT. Dans les deux cas, il faut évidemment que le cousinage se fasse par une lignée paternelle (Y) ou maternelle (MT) continue.
• Si le cousinage est éloigné (par exemple, il faut remonter 5 ou 6 générations en arrière pour un ancêtre commun), vous pourriez arriver à la limite de ce qu'un test ADN peut trouver (sauf Y et MT).

Si votre cousin n'est pas dans vos matches et devrait l'être, il reste des possibilités comme l'adoption secrète (les enfants adoptés ne savent pas toujours qu'ils le sont), l'infidélité, l'échange de bébé dans la maternité, le don de sperme ou la procréation assistée (ici aussi, les enfants ne sont pas toujours au courant). Certains font alors tester des cousins communs pour tenter de débloquer l'ascendance biologique.

Faire un test anonyme

Le but de la plupart des tests ADN commerciaux est de trouver soit des informations communes (signatures ADN d'ancêtres par exemple), soit des cousins. Pour cela, les résultats ADN sont comparés aux autres du labo utilisé. Mais si vous voulez voir les autres, alors les autres vous verront. Il est impossible d'être totalement anonyme dans un tel réseau. On peut prendre toutefois certains moyens comme ne pas montrer son nom réel (utiliser des initiales) et utiliser un courriel anonyme.

Si vous voulez seulement comparer 2 personnes et effacer les données par la suite, mais éviter de payer une 2e fois pour le même test, voici une solution possible. Faites les tests chez FTDNA, attendez les résultats, faites la comparaison et enregistrez les données brutes. Ensuite, vous désactivez vos matches. En haut à droite sous "Account Settings" en plaçant la souris à cet endroit, puis sous Privacy and Sharing, vous désactivez tout ce qui s'appelle "Opt in to Matching".